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一般來說，隨著水溫的降低，聚丙烯酰胺的水解速率變慢，顆粒的“布朗運動”強度也減弱，形成絮體所需的時間增加；此外，低溫下形成的絮體細小疏松，澄清效果變差。數據表明，當溫度在4 ~ 20之間時，絮體形成較快。
溫度對聚丙烯酰胺溶液有四種影響：
(1)疏水基團之間的相互作用是一個吸熱的熵驅動過程，即隨著溫度的升高，聚丙烯酰胺溶液體系的熵增加，疏水基團的締合增加，有利于溶液粘度的增加；
(2)隨著溫度的升高，離子基團的熱運動加劇，正負離子之間的相互作用減弱，導致大分子鏈延長，粘度增加；
(3)疏水基團熱運動加劇，疏水締合減弱。同時水分子熱運動加劇，從而改變疏水基團周圍水分子的結構和狀態，改變水-疏水基團的作用，進一步削弱疏水締合，降低粘度；
(4)隨著溫度的升高，離子基團的水合作用減弱，大分子鏈收縮，導致粘度降低。作為所有因素的結果，溶液的粘度發生變化(增加或減少)。
因此，在低溫條件下，聚丙烯酰胺絮凝劑的用量必須增加。另一方面，當水溫過高時，形成的絮體較小，污泥含水量增加，處理困難。所以水溫過高或過低都不利于絮凝。一般水溫條件應控制在20-30。